Модель 2005 года стала переходным звеном между вторым и четвёртым поколениями. Двигатель получил новую головку цилиндров, более лёгкие поршни и титановые выпускные клапаны. Рама была облегчена, маятник удлинён до 1385 мм колёсной базы. Передняя шина изменена с 120/60 на 120/70 ZR17 для улучшения сцепления на входе в поворот.
Внешние изменения минимальны: новые цвета, изменённая графика. Высота по седлу выросла до 830 мм. Снаряжённая масса - 183 кг. Ёмкость бака - 17 л. В некоторых рынках предлагалась версия R6S на базе предыдущего поколения с упрощённой подвеской.