В 2025 году Yamaha WR250F получила комплексное обновление, включая электронные ассистенты: систему 3-уровневого контроля тяги (Traction Control) и новую блокировку ECU с паролем для защиты от угона. Рама bilateral beam доработана, задний амортизатор получил ход 306 мм. Снаряжённая масса снижена до 113 кг, высота седла - 955 мм. Колёсная база сократилась до 1470 мм, дорожный просвет увеличен до 330 мм.
Двигатель - 250 см³, DOHC, 4-клапанный, степень сжатия 13,8:1. Объём бака уменьшен до 7,4 л. Передний тормоз - 270-мм диск, задний - 240-мм (облегчённый). Модель поддерживает приложение Power Tuner для настройки карт двигателя со смартфона. Цилиндр с керамическим покрытием (Plating).