Шестое поколение Yamaha Jog (CV50/SA16J) вышло в январе 2001 года. Скутер получил обтекаемый дизайн и впервые в истории модели - дисковый передний тормоз в стандартной комплектации. Главная особенность - опциональный дистанционный ключ (Remote Control), позволяющий запускать двигатель, открывать седло и отключать противоугонную систему G-Lock на расстоянии.
Двигатель - двухтактный A125E мощностью 6,3 л.с. (4,6 кВт) при 7000 об/мин. В марте 2001 года вышла спортивная версия Jog ZR Evolution с двигателем 6,5 л.с., литыми дисками и высоким спойлером. С 2003 года производство было перенесено на Тайвань (YMT).
Объём топливного бака - 5,7 л. Сухой вес: CV50 - 69 кг, ZR - 71 кг. Размер шин - 90/90-10. Это поколение стало последним двухтактным в истории модели.