Yamaha DT125RE выпускалась с 2003 по 2007 год. Главное новшество - электростартер (при сохранении кик-стартера), что существенно упростило эксплуатацию. Двигатель получил карбюратор Mikuni TM28-92, мощность составила 14,7 л.с. при 8000 об/мин, крутящий момент - 13 Н·м при 8000 об/мин. Степень сжатия - 6,7:1.
Мотоцикл был адаптирован к нормам Euro 2. Рама - стальная полудуплексная. Передняя подвеска - телескопическая вилка диаметром 41 мм с ходом 270 мм, задняя - Monocross с ходом 260 мм. Колёсная база - 1415 мм, высота по седлу - 900 мм, дорожный просвет - 300 мм. Тормоза - дисковые (230 мм спереди, 220 мм сзади). Объём бака - 10,7 л. Снаряжённая масса - около 126 кг.