В 2012 году GSX-R1000 получил очередное обновление. Поршни стали на 11% легче с измененной формой головки, степень сжатия повышена до 12,9:1. Мощность осталась на уровне 185 л.с. при 12 000 об/мин, но крутящий момент стал более равномерным.
Тормозная система обновлена: вместо Tokico установлены радиальные моноблочные суппорта Brembo с 4×32 мм поршнями и дисками 310 мм. Выхлопная система вернулась к одинарному глушителю, что снизило массу на 2 кг.
С 2015 года (L5) стала доступна опциональная ABS. В 2016 году вышла юбилейная версия 30th Anniversary Edition в цветах оригинального GSX-R750 1985 года.