В 2007 году GSX-R1000 получил существенные обновления, вызванные новыми экологическими нормами. Выхлопная система была переработана, что привело к увеличению массы на 6,4 кг. Для компенсации Suzuki улучшила аэродинамику, установила дроссельные заслонки большего диаметра и оптимизировала двигатель.
Мощность возросла до 185 л.с. при 11 000 об/мин. Появилась система S-DMS (Suzuki Drive Mode Selector) с тремя режимами работы двигателя: A (полная мощность), B (ограниченная до 50% открытия дросселя) и C (ограниченная во всем диапазоне). Сцепление стало гидравлическим.
В 2008 году модель не получила значительных изменений, кроме новых цветов.