В 1989 году CR250R получил перевернутую телескопическую вилку Showa - новинка, которая сначала была воспринята скептически, но позже стала стандартом. В 1990 году - полностью новый пластик и белая рама, цена $3995. 1992 год дал более мощный мотор, но рама оказалась слишком гибкой для такой мощности, что ухудшило управляемость. Проблему решили к 1994 году усилением рамы.

Пиком этой эпохи многие считают 1996 год - накопившиеся улучшения сделали его одним из лучших за всю историю модели.