Yamaha TT600E выпускалась итальянской компанией Belgarda с 1994 по 2003 год. Главное отличие от версии S - наличие электростартера (кикстартер сохранён как резервный). Для размещения аккумулятора и стартера пришлось переработать раму и масляную систему. Вес вырос: сухой - от 140 до 153 кг в зависимости от года выпуска. Ходы подвесок уменьшены - 270 мм спереди и сзади (против 310/270 у S). Высота по седлу снижена до 890–920 мм, что сделало байк доступнее для райдеров невысокого роста.
Двигатель - тот же 595-кубовый SOHC, но мощность варьировалась от 40 до 43 л.с. в зависимости от года. Крутящий момент - 48–51 Н·м при 5000–5500 об/мин. Топливный бак - 12 литров. Передний тормоз - диск 267–310 мм (менялся по годам). Подвески - нерегулируемые Yamaha или регулируемые в зависимости от года.
Модель TT600E стала самой массовой в серии - её ценили за универсальность: одинаково уверенно она чувствовала себя как на грунтовке, так и в городском потоке.