В 2007 году Bonneville получила серьёзное обновление: рабочий объём двигателя вырос до 865 см³, мощность увеличилась до 67 л.с., а крутящий момент - до 69 Н·м. С 2009 года карбюраторы уступили место электронному впрыску топлива, что улучшило холодный пуск, снизило расход топлива и обеспечило соответствие нормам Euro 3.
Версия T100 отличалась двухцветной окраской, хромированными деталями, тахометром и спицованными колёсами. Модификация SE (Special Edition) предлагала особые цвета и отделку. Выпускались также лимитированные серии, например, Bonneville 50th Anniversary. Модель оставалась на конвейере до 2015 года, после чего уступила место полностью новому поколению с жидкостным охлаждением.