В 1993 году GSX-R1100 получил вторую полную смену поколения. Масляное охлаждение уступило место жидкостному. Новый двигатель имел диаметр 75,5 мм и ход 60 мм (длинноходная конструкция), объём уменьшился до 1074 см³, но мощность выросла до 155 л.с. при 10000 об/мин.
Рама -全新的 с пятигранным сечением из кованых элементов. Маятник - асимметричный банановидный. Тормоза - 6-поршневые суппорты Nissin с дисками 310 мм. Сухой вес - 231 кг.
В 1995 году (WS) провели серьёзное обновление: вилка увеличена с 41 до 43 мм, маятник заменён на усиленный с перемычкой, изменены распредвалы и зажигание для улучшения тяги на средних оборотах. Вес снижен до 221 кг. Модели 1996–1998 годов получали только косметические изменения. В 1998 году производство GSX-R1100 завершилось.