В 1989 году GSX-R1100 получил серьёзное обновление. Двигатель увеличили до 1127 см³ (диаметр 78 мм, ход 59 мм), мощность выросла до 143 л.с. при 9500 об/мин. Появились новые карбюраторы Mikuni BST36SS Slingshot, двойные глушители и изогнутый масляный радиатор.
Рама стала жёстче на 25%, колёса уменьшились до 17 дюймов. Сухой вес вырос до 210 кг. Модель 1989 года (K) страдала проблемами с управляемостью, что привело к трагедии на Isle of Man TT.
В 1990 году (L) проблемы исправили: установили перевёрнутую вилку Showa, удлинили маятник на 40 мм, колёсная база выросла до 1465 мм. Мощность поднялась до 143 л.с. В 1991 году (M) - новый обтекатель с фарами под стеклом, карбюраторы увеличены до 40 мм, мощность 145 л.с. при 10000 об/мин. В 1992 году (N) - косметические изменения.