В 2018 году Yamaha представила обновлённое седьмое поколение YZF-R1 (код RN49), приведённое в соответствие с нормами выбросов Euro 4. Основные изменения коснулись электронных систем: улучшенный квикшифтер QSS обеспечивал более чёткое переключение передач, система контроля подъёма переднего колеса LIF получила новые алгоритмы работы. Версия R1M получила новую электронную подвеску Ohlins ERS с полуактивным управлением.
Технические характеристики двигателя и ходовой части остались без изменений по сравнению с поколением 2015-2017 годов.