В 2006 году Yamaha полностью пересмотрела конструкцию рамы, перейдя со стали на алюминий, что уменьшило вес и улучшило центровку массы. Более 300 деталей были изменены или улучшены по сравнению с предыдущей версией.
Коробка передач получила пятую передачу, что сделало мотоцикл удобнее не только на кроссовой трассе, но и в эндуро и пустынных гонках. Мощность заводских японских версий достигала около 60 л.с. при 9000 об/мин.