Третье поколение Yamaha Cygnus X (NXC125N) дебютировало 26 июня 2012 года. Дизайнер - Ван Яодэ (王耀德), руководитель проекта - Цзэн Цисинь (曾啟信). Концепция дизайна: refinement (утончённость), sportiness (спортивность), aesthetics (эстетика). Фары получили переработанный рефлектор для более сфокусированного света, а LED-габаритные огни были впервые вынесены под фару отдельно.
Тормозная система улучшена: увеличенный до 245 мм передний тормозной диск, площадь колодок увеличена на 12%, тормозной шланг укорочен на 16.3 см для более прямого торможения. Всё это дало прирост эффективности торможения на 19%. Рама облегчена на 3% без потери жёсткости. Количество деталей уменьшено на 5%.
Подседельное пространство увеличено на 10.5% (с 28.5 до 31.5 л). Передний отсек для мелочей увеличен на 13.2%. Пространство для ног увеличено на 15 мм. Приборная панель получила индикатор напряжения. Сухой вес снижен до 113 кг (на 1 кг легче предыдущего поколения).