Первое поколение Yamaha Cygnus X (NXC125) было представлено в 2004 году как развитие предыдущей модели Cygnus. Скутер оснащался 124-кубовым двигателем с воздушным охлаждением, SOHC, 4 клапана на цилиндр. Система питания - карбюратор Keihin CVK24 (с 2005 года - карбюратор с TPS). Мощность двигателя - 10.4 л.с. (7.8 кВт) при 8500 об/мин, крутящий момент 9.2 Нм при 7500 об/мин.
Подвеска - телескопическая вилка спереди и два задних амортизатора. Тормоза - передний гидравлический диск 220 мм, задний барабан 150 мм. Колёса 12 дюймов, шины 110/70-12 спереди и 120/70-12 сзади. Рама - стальная underbone. Колёсная база 1295 мм, дорожный просвет не указан, минимальный радиус разворота 1.9 м.
Объём багажного отсека под седлом - 28.5 л. Топливный бак 7.1 л. Снаряжённая масса 119 кг, сухая 112 кг. Высота по седлу 755 мм. Выпускались версии 4V, SR, SR Evolution и STD с различными цветовыми решениями.