В 1993 году из-за обновления японского законодательства максимальная мощность для 400-кубовых мотоциклов была снижена с 59 до 53 л.с. Suzuki GSX-R400R (заводской код GK76A) выпускался с 1993 по 1995 год с пониженной мощностью 53 л.с. при 12000 об/мин и крутящим моментом 36 Нм при 10000 об/мин.
Конструктивно байк остался практически таким же, как в 1990-1992 годах: та же рама, перевёрнутая вилка, тормоза Nissin. Сухой вес увеличился до 169 кг. В 1993 году версия SP (Sports Production) выпускалась последний раз. В 1994-1995 годах модель получала только новые цвета и графику. Производство Suzuki GSX-R400R завершилось в 1995 году.
Двигатель этой модели впоследствии устанавливался на Suzuki GSF400 Bandit и Suzuki RF400.