В 1988 году Suzuki GSX-R250 получила косметическое обновление. Мотоцикл сохранил прежнюю механическую начинку, но приобрёл новый дизайн графики. Передние указатели поворотов стали дымчатыми и были интегрированы в обтекатель, аналогично старшей модели GSX-R750 того же периода. Зеркала заднего вида также были переработаны.
Цветовые варианты включали красно-чёрную расцветку с белыми логотипами GSX-R и Suzuki, чёрную с серебристо-серыми и красными логотипами, а также бело-синюю версию в гоночных цветах Suzuki. В мае добавились чёрная версия с бронзовыми логотипами и красно-белая расцветка.