KTM 520 EXC 1998-1999 годов - это первая серийная версия модели с новым четырёхтактным двигателем RFS (Racing Four Stroke). Мотоцикл был разработан для соревнований по эндуро и пришёл на смену двухтактным моделям. Двигатель объёмом 520 см³ оснащался электростартером, что было редкостью для внедорожных мотоциклов того времени.
Модель получила 6-ступенчатую коробку передач, хромомолибденовую раму и подвеску WP. Передняя вилка - перевёрнутая WP USD диаметром 43 мм, задний амортизатор - WP с системой PDS. Тормозная система - дисковые тормоза Brembo. Мотоцикл был доступен в оранжевой цветовой гамме, ставшей визитной карточкой KTM.