В 2004 году KTM провела серьёзное обновление двигателя. Новые размеры цилиндра и поршня (72x72 мм) дали рабочий объём 293 см³. Карбюратор был уменьшен с 38 до 36 мм, что решило проблемы с настройкой смеси и снизило вес на 3,6 кг.
С 2006 года для американского рынка модель EXC была заменена на две версии: XC (close-ratio) с близким рядом передач, без проводки для света и более жёсткой подвеской, и XC-W (wide-ratio) с широким рядом передач, фарой, задним фонарём и мягкой подвеской PDS. В 2007 году появился переключатель двух режимов зажигания на руле.