В 2007 году Kawasaki выпустила обновлённую версию Z1000. Двигатель остался 953-кубовым, но был перенастроен для улучшения тяги на средних оборотах в ущерб пиковой мощности (125 л.с. против 127 л.с. у предшественника). Выхлопная система получила новые глушители угловатой формы с клапаном в правом банке.
Рама осталась стальной, но геометрия была изменена: колёсная база выросла до 1445 мм, дорожный просвет - до 160 мм. Передние тормоза получили радиальные 4-поршневые суппорты. Впервые стала доступна ABS в качестве опции. Снаряжённая масса выросла до 228 кг (232 кг с ABS).