В 2016 году Honda провела первое значительное обновление CBR500R. Мотоцикл получил более агрессивный дизайн обтекателя, вдохновленный старшей моделью CBR1000RR Fireblade. Главные изменения: светодиодная головная оптика (LED), передняя вилка с регулировкой преднатяга, новый выпускной коллектор и глушитель для соответствия стандартам Euro 4.
Топливный бак был увеличен с 15.5 до 16.7 л. Появилась откидная крышка бензобака и регулируемый рычаг тормоза. Обновленная приборная панель получила новые функции. Снаряженная масса снизилась до 192 кг.
Двигатель остался прежним - 471 куб.см, 47 л.с. при 8500 об/мин, 43 Нм при 7000 об/мин. Шестиступенчатая коробка передач без изменений.