Первое поколение Honda CBR500R было представлено в ноябре 2012 года на выставке EICMA в Милане и поступило в продажу весной 2013 года. Модель была создана специально для новых европейских правил категории A2, ограничивающих мощность мотоциклов 35 кВт (47 л.с.).
Мотоцикл оснащался 471-кубовым 4-тактным DOHC параллельным twin с жидкостным охлаждением, 8 клапанами и системой впрыска PGM-FI. Диаметр цилиндра 67 мм, ход поршня 66.8 мм, степень сжатия 10.7:1. Максимальная мощность составляла 35 кВт (47 л.с.) при 8500 об/мин, крутящий момент 43 Нм при 7000 об/мин.
Подвеска: 41-мм телескопическая вилка спереди и Pro-Link моноамортизатор с 9-ступенчатой регулировкой преднатяга сзади. Тормозная система: одинарный 320-мм волнообразный диск с 2-поршневым суппортом спереди и 240-мм диск с 1-поршневым суппортом сзади. ABS была опциональной. Колесная база 1410 мм, высота по седлу 785 мм, снаряженная масса 194 кг. Объем бака 15.5 л.
В 2013 и 2014 годах CBR500R использовался в European Junior Cup - гоночной серии Honda в рамках чемпионата World Superbike.