В 2006 году Honda провела серьёзное обновление спортивной 250-кубовой линейки. Квадроцикл получил новый агрессивный дизайн в стиле старшего TRX450R, инновационное сцепление SportClutch (позволяющее использовать ручное сцепление без риска заглохнуть), усиленные амортизаторы (27 мм спереди и 32 мм сзади) и новую систему включения заднего хода.
С 2009 года модель сменила название с TRX250EX на TRX250X. Технически квадроцикл остался прежним: 229-кубовый 4-тактный OHV двигатель, 5-ступенчатая КПП с задним ходом, карданный привод. В 2012 году модель получила новые шины Maxxis Razr Vantage и алюминиевые колёса.
Актуальное поколение TRX250X выпускается по сей день. Современные версии оснащаются 229-кубовым двигателем мощностью около 16-17 л.с., 5-ступенчатой КПП со сцеплением SportClutch, независимой передней подвеской (150 мм хода) и маятниковой задней (145 мм хода). Снаряжённая масса - 174,6 кг.