С 2003 года Yamaha привела модель V-Max 1200 в соответствие с новыми экологическими стандартами. Мощность североамериканских версий была снижена: для США - до 135 л.с., для Канады - до 140 л.с. Европейские версии больше не выпускались. В 2007 году, в последний год производства, все версии для всех рынков были унифицированы с мощностью 135 л.с.
Внешних изменений практически не произошло, но мотоцикл получил обновлённую выхлопную систему и настройки зажигания. В 2007 году производство легендарного V-Max 1200 было окончательно завершено, а его место в 2009 году заняла модель VMAX с двигателем 1679 см³.