В январе 1985 года Yamaha выпустила обновлённую версию RZ50 (модельный код 1HK). Главные внешние отличия - верхний и нижний обтекатели, которые придали мотоциклу более "закрытый" облик. Высота модели выросла до 1120 мм против 1000 мм у исходной версии. Сухой вес увеличился до 76 кг, снаряжённая масса составила 88 кг. Высота по седлу - 760 мм, дорожный просвет - 200 мм.
С 1983 года в Японии действовало ограничение максимальной скорости 50-кубовых мотоциклов до 60 км/ч, поэтому на обновлённую RZ50 был установлен скоростной ограничитель. Тем не менее двигатель остался прежним: 7,2 л.с. при 9000 об/мин, 6,1 Н·м при 8000 об/мин. Цветовая гамма сократилась до одного белого цвета. Модель выпускалась вплоть до середины 1990-х годов без существенных изменений, параллельно с более спортивной TZR50.