В 1998 году Suzuki GSX-R750 получила электронный впрыск топлива вместо карбюраторов. Модель W оснащалась 46-мм дроссельными заслонками с двухстадийной системой управления, которая учитывала температуру охлаждающей жидкости и всасываемого воздуха, атмосферное давление, положение дросселя и обороты двигателя.
Мощность выросла до 134-135 л.с. Рулевой демпфер перенесён под нижнюю траверсу. Заднее колесо шириной 6 дюймов с шиной 190/50ZR17. Модель 1999 года получила награду Sportbike of the Year.