В 1989 году Suzuki провела первое серьёзное обновление GSX-R1100. Модель K получила новый двигатель с увеличенным до 1127 см³ рабочим объёмом (78 x 59 мм), новые карбюраторы Mikuni BST36SS, систему Ram Air и два глушителя. Мощность выросла до 143 л.с. при 9500 об/мин, крутящий момент - до 111.8 Нм при 7250 об/мин.
Рама была полностью переработана - жёсткость увеличена на 25%. Колёса уменьшились до 17 дюймов. Однако модель 1989 года (K) получила нарекания за недостаточную устойчивость на высоких скоростях, что привело к трагическим инцидентам на гонке Isle of Man TT.
В 1990 году (модель L) проблемы были исправлены: установлена перевёрнутая вилка Showa, удлинён маятник (колёсная база выросла до 1465 мм), расширены шины (130/60 спереди, 160/60 сзади). Мощность поднялась до 143 л.с.