Третье поколение GSX-R1100 (1991-1992) стало вершиной развития воздушно-масляной серии. Двигатель 1127 см³ получил карбюраторы Mikuni BST40SS увеличенного диаметра (40 мм вместо 36 мм), новые распредвалы с облегчёнными коромыслами и масляное охлаждение верхних передач КПП. Мощность выросла до 145 л.с. при 10000 об/мин, крутящий момент - 114 Нм при 9000 об/мин.
Внешность была существенно изменена: фары впервые разместились за прозрачным аэродинамическим экраном, что улучшило обтекаемость. Подвеска получила более широкий диапазон регулировок. Колёсная база увеличилась до 1465 мм. Задняя шина расширилась до 180/55ZR17.
Модель 1992 года (N) отличалась только новыми цветами и графикой. Это был последний год выпуска GSX-R1100 с масляным охлаждением.