Второе поколение Kawasaki KLX250 было представлено в 1993 году и включало несколько модификаций: KLX250R (KLX250-D) - внедорожная версия, KLX250SR (KLX250-E) - дорожная версия для Европы и Японии, KLX250 (KLX250-G) - версия для ДОП в некоторых странах Европы, KLX250ES (KLX250-F) - версия для Японии с электростартером и мощной фарой.
Модель получила полностью новый 4-тактный двигатель объёмом 249 см³ с жидкостным охлаждением, DOHC и 4 клапанами. Мощность варьировалась от 25 до 32 л.с. в зависимости от модификации. Впервые появились дисковые тормоза и перевёрнутая вилка.