Z50J - японская и европейская версия, пришедшая на смену Z50A на этих рынках. Модель выпускалась с 1973 по 1999 год и стала самой долгоживущей модификацией Z50. В 1978 году Z50J получила обновление: вместо 3-ступенчатой полуавтоматической коробки передач была установлена 4-ступенчатая механическая с ручным сцеплением, а задний тормоз вернулся на ножную педаль.
Параллельно в Японии продолжали выпускаться версии Z50M для внутреннего рынка. В 2017 году, после объявления об окончании производства из-за новых экологических норм, Honda выпустила 50th Anniversary Special Edition тиражом 500 штук. Юбилейная модель сочетает элементы Z50A (1968) и Z50AK3 (1972) с клетчатым сиденьем, повторяющим оригинальный Z50M, и хромированными деталями. Продажа проводилась через онлайн-лотерею по цене ¥432,000.