NSR125R JC20 - полностью фейрдовая версия модели, поступившая в продажу в феврале 1989 года. Мотоцикл получил полный обтекатель с двойными круглыми фарами, придававшими ему сходство со старшими моделями CBR600. В отличие от версии F, здесь применялась удлинённая главная передача для лучшей реализации аэродинамики.
В 1991 году модель получила обновление: трёхспицевые колёса Grimeca сменились шестиспицевыми, изменился передний крыло, на хвостовой части появился графический элемент в виде гоночной таблички. Цветовые схемы также обновлялись ежегодно.
На некоторых рынках (Великобритания) мотоцикл продавался с жёстким ограничением мощности до 12 л.с. для соответствия местным законам об ученических правах. Итальянские и другие европейские версии поставлялись в полной мощности.