В 1990 году Honda выпустила лимитированную серию GL1500SE Special Edition, посвящённую 15-летию модели Gold Wing. Версия отличалась повышенным уровнем комфорта и роскоши: двухцветная окраска кузова, вентилируемое ветровое стекло с возможностью частичного открытия, задний спойлер со встроенным стоп-сигналом на крышке багажника, подсветка переключателей на руле, регулируемые подножки пассажира, система обдува тёплым воздухом ног пассажира.
С 1993 года в стандартное оснащение SE вошло CB-радио (ранее опция). В 1995 году высота сиденья была снижена на 40 мм за счёт изменения формы пены. С 1997 года использовались усиленные компоненты двигателя и трансмиссии от модели Valkyrie. Версия SE оставалась в производстве до 2000 года включительно.