Базовая версия Yamaha TTR125 дебютировала в 2000 году и выпускалась до 2004-го. Эта модификация оснащалась малыми колёсами - 17 дюймов спереди и 14 дюймов сзади, что обеспечивает высоту по седлу 775 мм. Мотоцикл предназначен для райдеров невысокого роста и подростков.
Особенности: только кикстартер (без электростартера), барабанные тормоза спереди и сзади (диаметр 110 мм), стальной маятник, телескопическая вилка диаметром 30 мм с ходом 180 мм, задний моноамортизатор с ходом 160 мм. В 2002 году производитель усилил задний ступичный узел для повышения надёжности. Модель снята с производства после 2004 модельного года.