В 2013 году Yamaha представила версию Aerox Naked - скутер без пластикового обтекателя руля, что придало ему вид мотоцикла в стиле нейкед. Приборная панель осталась той же, что у Aerox R (с тахометром и ЖК-дисплеем). Двигатель - двухтактный, 49 см3, жидкостное охлаждение. Производство осуществлялось до 2016 года для европейских рынков, где не требовалась защита рук.
Эта модификация была особенно популярна среди молодых водителей, желавших выделиться. Цветовая гамма включала матовые оттенки и яркие акценты, например чёрно-жёлтую схему. Ходовые характеристики идентичны Aerox R: телескопическая вилка, дисковые тормоза, 13-дюймовые колёса. Снаряжённая масса - 97 кг.