В 2013 году Yamaha представила четырёхтактную версию Aerox - модель получила обозначение Aerox 4 (внутренний код NS50 4T). Двигатель - 49 см3, SOHC (одновальный), жидкостное охлаждение, с электронным впрыском топлива. Мощность составляет 3,45 л.с., что сопоставимо с двухтактными версиями, но при этом мотор работает тише, расходует меньше топлива и не требует смешивания масла.
Внешне Aerox 4 отличается новой решёткой радиатора, изменённой формой боковых панелей и глушителем. Приборная панель - цифровая, с ЖК-дисплеем. Колёса - 13 дюймов, но шины другого размера: спереди 120/70-13, сзади 130/60-13. Объём топливного бака уменьшен до 6 литров. Версия выпускалась до 2021 года для европейского рынка.