Финальные модификации Yamaha FZR400RR-SP, выпускавшиеся с 1992 по 1994 год. Из-за изменений в японском законодательстве, ограничивающих мощность мотоциклов, производительность была снижена до 53 л.с. (39 кВт) при 12000 об/мин. Степень сжатия сохранена на уровне 12,2:1.
Модификация 3TJ6 (1992-1993) получила карбюраторы Keihin FCR32 (плоскозолотниковые) вместо прежних Mikuni BDST32, close-ratio КПП (2,461/1,941/1,631/1,500/1,368/1,250), усиленное сцепление и регулируемую подвеску. Выпущено около 2000 экземпляров.
Финальная модификация 3TJ7 (1994) была выпущена ограниченной серией всего 500 единиц. Отличалась только цветовой схемой и графикой. На этом завершилось производство всей линейки Yamaha FZR400. После 1994 года модель не выпускалась из-за снижения спроса на 400-кубовые спортбайки и ужесточения экологических норм.