Третья серия Yamaha FZ750 выпускалась с 1989 по 1991 год и стала финальной в истории модели. Главное нововведение - замена 16-дюймового переднего колеса на 17-дюймовое, что позволило использовать современные радиальные шины. Заднее колесо также получило более широкий обод с покрышкой 140/70-18.
Значительно улучшена тормозная система: передние диски увеличены до 298 мм (плавающего типа) с 4-поршневыми суппортами. Оба колеса - полые спицевые, что снизило неподрессоренные массы. Габариты: длина 2235 мм, высота 1200 мм, колесная база 1490 мм. Снаряженный вес вернулся к 232 кг. Цветовые схемы стали более спокойными. Для швейцарского рынка мощность ограничивали до 100 л.с.