1986 год стал дебютным для Yamaha FZ600. Модель была представлена под слоганом "Pure Sports" и позиционировалась как первый настоящий спортбайк Yamaha в среднем классе. Байк получил полный обтекатель с двумя круглыми фарами, характерными для более дорогих моделей FZR.
В этом году мотоцикл выходил в двух основных цветовых схемах: красно-белой и сине-белой. Рама была окрашена в серебристый цвет. Колёса - трёхспицевые литые алюминиевые. Ходовая часть настраивалась через пневморегулировку вилки и предварительную нагрузку заднего амортизатора.
Заявленная мощность двигателя составляла 68 л.с. (по данным Cycle World), реальная мощность на заднем колесе - около 54,6 л.с. Первоначальная цена в США - $3199, что было значительно дешевле конкурентов с водяным охлаждением.