Первое поколение FZ6 дебютировало в 2004 году и стало доступно в двух вариантах: FZ6-N (голый нейкед) и FZ6-S Fazer (с полуобтекателем). Мотоцикл получил новый алюминиевый каркас Controlled Fill, 43-мм вилку, подвеску Monocross и двигатель от YZF-R6 с изменёнными распредвалами для лучшей тяги на низах и середине.
Особенности: групповая система впрыска с 36-мм дросселями, подседельный выпускной коллектор, LCD-приборная панель с цифровым спидометром и полосчатым тахометром. Спереди установлены два 298-мм диска с 2-поршневыми скользящими суппортами. В 2006 году модель получила обновления: чёрные колёса, новый катализатор, оптимизированную карту впрыска.