KTM 360 MXC (Motocross Cross-Country) - версия для кросс-кантри, занимавшая промежуточное положение между эндуро-версией EXC и кроссовой SX. Модель была ориентирована на длительные гонки по пересечённой местности, где требовалась как высокая скорость, так и надёжность.
Версия MXC имела увеличенный топливный бак (13 литров для американской версии), что позволяло совершать длительные поездки без дозаправки. Передаточные числа коробки передач были близки к версии EXC: первичная передача 26:72, 1-я 15:29, 2-я 18:26, 3-я 19:24, 4-я 21:23, 5-я 23:21. Вторичная передача - 14:50.
Модель 360 MXC оснащалась теми же тормозами Brembo и подвеской Marzocchi/Ohlins, что и другие версии 360. Байк выпускался в 1996-1997 годах и был особенно популярен в США, где гонки кросс-кантри имели большую популярность.