В 1991 году Kawasaki провела серьёзный рестайлинг модели. Мотоцикл получил новый дизайн обтекателей, изменённую переднюю оптику и новые колёса. Двигатель был модернизирован: диаметр цилиндра увеличился до 49 мм, а ход поршня уменьшился до 33,1 мм, что позволило двигателю легче набирать обороты.
Мощность осталась на уровне 45 л.с., но пик достигался при 16000 об/мин. Крутящий момент составил 24 Нм при 11500 об/мин. Ёмкость топливного бака была уменьшена с 16 до 15 литров, сухой вес снизился до 141 кг. Колёсная база сократилась с 1370 до 1360 мм.
Версия ZXR250R (ZX250D) продолжала выпускаться с увеличенными карбюраторами и спортивной подвеской.