Около 2006 года Kawasaki обновила дизайн KX100, представив новый симметричный пластик и графику в стиле старших моделей KX125 и KX250. Рама, двигатель и подвеска остались без существенных изменений, но новый облик сделал мотоцикл визуально более современным.
Модели этого периода сохранили систему KIPS, 36-мм перевёрнутую вилку и заднюю подвеску Uni-Trak. Цвет - традиционный лаймово-зелёный.