В 2017 году Kawasaki провела кардинальное обновление модели. Мотоцикл получил новое название - Ninja 650 (без приставки ER-6f), новую решётчатую раму из высокопрочной стали (треллис), новый маятник и горизонтально расположенный задний амортизатор (Horizontal Back-link). Снаряжённая масса снизилась на 19 кг - до 193 кг.
Двигатель объёмом 649 см³ был перенастроен для соответствия нормам Euro 4: мощность снизилась до 68 л.с. при 8000 об/мин, крутящий момент - 65.7 Н·м при 6500 об/мин. Модель получила ассистент и проскальзывающее сцепление (assist & slipper clutch), новую выхлопную систему под двигателем, регулируемый ветровик и современную приборную панель с аналоговым тахометром и цифровым дисплеем.
Дизайн передней части был выполнен в стиле старшей модели ZX-10R. Высота по седлу снижена до 790 мм. ABS стала доступна как опция. В 2018 году появилась версия KRT Edition с ливреей Kawasaki Racing Team.