В 1985 году модель XR350R получила наиболее существенные изменения за всю историю производства. Рабочий объём двигателя был увеличен с 339 до 353 см³ за счёт увеличения хода поршня на 3.5 мм. Мотор перешёл с мокрого картера (wet sump) на сухой (dry sump), что улучшило охлаждение и позволило разместить масло в раме. Два карбюратора Keihin 26 мм заменил один 35-мм, что упростило обслуживание и настройку.
Маятник и рычаг кикстартера стали алюминиевыми, что снизило вес. Вместо обычного спидометра появился многофункциональный цифровой эндуро-метр с одометром и сбрасываемым трипметром. Пружины вилки и чехлы стали синими. Надпись Pro-Link на маятнике - синяя. Модель поставлялась в цвете Flash Red с синим сиденьем и жёлтыми номерными панелями.