Второе поколение Yamaha YP400 Majesty (SH05) было представлено в конце 2008 года как модель 2009 года. Это был серьёзный рестайлинг первого поколения, затронувший внешность и техническую начинку скутера.
Основные изменения коснулись дизайна: передняя оптика получила новую форму, изменился дизайн задних фонарей. Производитель доработал вариатор и ремень привода, что улучшило плавность разгона. Была улучшена шумоизоляция двигателя. Главным технологическим нововведением стала опциональная ABS - впервые для данной модели.
Двигатель остался прежним - 395 см³, 34 л.с. (25 кВт) при 7000 об/мин, 36,3 Н·м при 6000 об/мин. Колёсная база, высота по седлу и остальные габариты не изменились. В Японии модель продолжала продаваться как Grand Majesty 400 (YP400G) и также получила обновление в 2009 году.