В 2007 году Yamaha выпустила обновлённую версию XF50 с улучшенной передней вилкой - вместо фрикционных демпферов появились масляные, что повысило комфорт при езде по неровностям. Также в линейку добавлена версия XF50D (Deluxe) с хромированными деталями: корпусом приборов, ободом фары, зеркалами, рулём и петлёй сиденья.
Двигатель и трансмиссия остались без изменений. Цветовая гамма: синий металлик, серебристый и новый жёлтый. В 2008 году добавились красный и зеленовато-белый. На рынке США и Канады модель продавалась как C3 (C-Cubed). В Северной Америке байк предлагался в 2007-2008 модельных годах.