Yamaha TZR50 дебютировала в феврале 1990 года как первый 50-кубовый полноразмерный спортбайк Yamaha с полным обтекателем. Модель базировалась на стальной раме типа double cradle, оснащалась водяным охлаждением, дисковыми тормозами спереди и сзади, а также 6-ступенчатой коробкой передач.
Двигатель - двухтактный одноцилиндровый (модель 3TU) рабочим объемом 49 см³ с поршнево-золотниковым впуском. Система питания - карбюратор Mikuni VM16SS. Мощность в 7,2 л.с. достигалась при 9000 об/мин, крутящий момент 6,4 Н·м - при 7500 об/мин. Сухая масса составляла 83 кг.
В 1992 году проведено небольшое обновление: изменена калибровка зажигания для улучшения отклика на газ, доработана подвеска, скорректировано положение руля. В марте 1993 года на смену модели пришла TZR50R.