Модификация TY350S выпускалась в 1986 году и завершала короткую двухгодичную историю модели TY350. В техническом плане мотоцикл не претерпел изменений по сравнению с версией 1985 года: тот же двигатель, та же ходовая часть и та же моноподвеска Monocross. Цветовые решения остались прежними (белый / красный).
Причиной прекращения выпуска стал низкий спрос: рынок США не проявил достаточного интереса к триальному спорту, и Yamaha не стала продолжать производство. Тем не менее TY350S остаётся востребованной среди коллекционеров и любителей классического мототриала благодаря удачной конструкции и хорошей ремонтопригодности.