Первое поколение Yamaha MR50 выпускалось с 1972 по 1978 год. Мотоцикл был представлен в июне 1972 года одновременно с моделью FX50. Байк имел общую с FX50 раму и двигатель, но отличался внедорожным стайлингом, длинным высоко поднятым глушителем и несколько дефорсированным мотором.
Двигатель - двухтактный одноцилиндровый воздушного охлаждения рабочим объёмом 49 см³. Максимальная мощность составляла 6 л.с. при 9000 об/мин, крутящий момент - 0.5 кгс·м (4.9 Н·м) при 8000 об/мин. Коробка передач - 5-ступенчатая механическая. Колёса - 2.50-17 спереди и сзади.
В 1976 году была обновлена цветовая гамма модели. В 1977 году производитель увеличил размер колёс, повысил светоотдачу фар и заменил нижнюю часть передней вилки на алюминиевую. Габариты первого поколения: длина 1830 мм, ширина 790 мм, высота 990 мм. Цена на момент выхода в Японии составляла 82 000 иен.