Первое поколение Yamaha FJ1200 (заводской код 1TX) выпускалось с 1986 по 1987 год. Модель пришла на смену FJ1100 и во многом сохранила его конструктивные особенности. Мотоцикл оснащался 16-дюймовым передним колесом, антиклевковой системой Anti-dive, аналоговым транзисторным зажиганием TCI и 2-поршневыми передними тормозными суппортами с невентилируемыми дисками диаметром 282 мм. Задний тормоз - 1-поршневой суппорт. Подача топлива - гравитационная (без бензонасоса). Задний маятник - алюминиевый. Снаряжённая масса составляла 258 кг.
На рынке США модель продавалась под обозначениями FJ1200S (1986) и FJ1200T (1987). В Европе использовались коды 1TX (Великобритания), 1XJ (Германия), 1WH (Франция).